Το ΙΕΚ Σιδηροκάστρου, ως παράρτημα του ΙΕΚ Σερρών λειτούργησε για πρώτη φορά το Φεβρουάριο του 1998 με την ειδικότητα Ειδικός Φοροτεχνικού Γραφείου.Από το 1998 μέχρι και σήμερα από το ΙΕΚ Σιδηροκάστρου αποφοίτησαν 542 καταρτιζόμενοι.
Το ΙΕΚ Σιδηροκάστρου στεγάζεται στο Παλλατίδειο Γυμνάσιο-Λύκειο, διαθέτει εργαστήρια πληροφορικής και κομμωτικής, ενώ για τις εργαστηριακές ανάγκες των ειδικοτήτων που υλοποιούνται συνεργάζεται με τους Φορείς Τοπικής Αυτοδιοίκησης καθώς και με επαγγελματίες της ευρύτερης περιοχής του Δήμου Σιντικής.
Το ΙΕΚ Σιδηροκάστρου από τον Νοέμβριο του 2013 υφίσταται ως ανεξάρτητο και αυτόνομο ΙΕΚ.